More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1081 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
150 aa  294  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 
148 aa  140  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 
154 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 
154 aa  123  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 
153 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
165 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
163 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
163 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
155 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 
158 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  40.57 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  40.57 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  30.5 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.59 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  37.38 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.84 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  34.97 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.46 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  34.35 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  30.19 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  29.58 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
204 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  32.09 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  38 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  30.77 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  38 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>