More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2357 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 201 aa  84.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  36.29 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  33.57 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  32.81 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.92 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  31.58 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.22 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.31 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  28.82 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1093  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  29.45 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.76 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  29.76 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  28.47 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  32.82 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  29.56 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  29.14 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  29.82 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>