More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1688 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  51.52 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  48.44 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4023  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000409916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 169 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 169 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  40.31 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  44.62 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 170 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 166 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.71 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.71 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.42 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.13 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  34.06 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.18 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  36.3 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>