More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0928 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 148 aa  290  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  39.34 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  38.81 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  36.81 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.64 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.06 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  34.78 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  31.17 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.21 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  30.83 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  30.83 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  39.37 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  32.45 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  32.46 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  33.63 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  31.2 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  29.49 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.82 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>