More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09461 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 151 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  80 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  59.21 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  39.2 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  45.38 
 
 		 178 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  44.54 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  42.19 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  41.28 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  30.26 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 182 aa  76.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  31.13 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.07 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.57 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  29.22 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  44.09 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  30.87 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  36.88 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.04 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>