More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0553 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
153 aa  300  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  60.39 
 
 
154 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
150 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  42.22 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 
145 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 
154 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 
154 aa  102  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 
155 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
150 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.2 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.76 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
163 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
163 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 
176 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  37.75 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 
178 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.82 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.3 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.65 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  33.11 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  38.35 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  41.59 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>