More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2249 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  54.55 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  44.96 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.4 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 155 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  31.4 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.13 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  35.93 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  28.82 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  34.42 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0688  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  30.14 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  30.26 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  31.9 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  26.76 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  28.05 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>