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for query gene PMT9312_0885 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
152 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  80 
 
 
151 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  63.76 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
160 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 
173 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  30.41 
 
 
358 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  45.38 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  29.56 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.57 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  29.14 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  31.08 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
163 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  36.49 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  31.97 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  31.97 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  30.56 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
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NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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