More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0281 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  80.53 
 
 		 197 aa  300  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 144 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  41.13 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.91 
 
 		 159 aa  84.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  40.79 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.58 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  43.8 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.69 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  39.07 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  38.46 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  41.23 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>