More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0707 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  67.26 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  58.58 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  56.63 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  58.39 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  52.47 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  54.09 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  34.1 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.49 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 158 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.9 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  28.43 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.21 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  31.97 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.94 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  28.65 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  28.3 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.31 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  35.62 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  32.03 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>