152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3677 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  56.08 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  53.18 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  42.71 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  42.39 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  42.55 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  38.81 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  35.98 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  42.24 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  40.64 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  37.08 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  28.43 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  31.9 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  29.1 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  29.06 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  27.13 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  30.32 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  24.08 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  27.93 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  29.65 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  27.27 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  28.86 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  28.22 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  28.22 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  28.22 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  25.79 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  29.55 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  27.49 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  25.76 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  26.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  27.64 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  27.22 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  25.93 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  25.84 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  28.81 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  27.89 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  24.49 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  29.41 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  26.5 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  27.49 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  27.09 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  29.13 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  27.68 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  27.22 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  29.15 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  27.36 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  27.36 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  27.36 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  28 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  26.92 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  29.48 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  27.17 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  28.86 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  28.86 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  26.6 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  26.97 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  25.63 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  25.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  24.74 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  24.46 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  25.97 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  26.59 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  29.06 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  26.96 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  27.6 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  24.87 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  26.51 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  27.23 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  31.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>