More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2067 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  339  9e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  68.1 
 
 		 167 aa  230  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  60.95 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  58.58 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  63.75 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  56.69 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  35 
 
 		 200 aa  84.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.25 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  34.59 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  31.98 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.05 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.69 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.21 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  29.1 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.86 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  31.37 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.8 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 153 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.74 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  31.61 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>