171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02475 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  63.32 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  62.31 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  51.5 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  52.31 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  42.16 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  41.57 
 
 		 261 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  41.11 
 
 		 240 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  36.9 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  32.99 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  28.92 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  30.73 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  26.63 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  29.08 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  27.5 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  31.49 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  29.28 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  26.8 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  28.73 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  26.11 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  25.41 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  30.21 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  27.08 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  27.03 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  24.87 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  27.92 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  28.02 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  28.11 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  27.57 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  27.42 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  29.74 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  25.51 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  25.95 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  26.78 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  28.12 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  27.78 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  26.23 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  28.21 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  28.96 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  28.21 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  26.37 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  28.21 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  28.72 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  27.92 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  27.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  29.51 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  26.49 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  27.22 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  27.37 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  27.47 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  23.81 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  25.95 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  27.5 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  24.86 
 
 		 145 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  25.76 
 
 		 170 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  26.37 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  26.23 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  27.22 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  25.14 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  28.02 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  26.88 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  24.74 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  27.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  25.64 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  28.7 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  28.02 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  29.44 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  28.73 
 
 		 364 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  27.32 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>