79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5729 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  76.6 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  56.08 
 
 		 205 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  43.68 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  41.57 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  39.9 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  41.58 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  41.28 
 
 		 193 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  27.08 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  31.03 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  27.98 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  29.58 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  29.78 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  25.89 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  24.86 
 
 		 145 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  21.35 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  27.72 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0190  peptidase A8 signal peptidase II  32.05 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.459328  normal  0.539707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  25.64 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  26.7 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  28.33 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  29.41 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  24.17 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  26.87 
 
 		 163 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  28.65 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  24.32 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  27.37 
 
 		 160 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  28.42 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  26.7 
 
 		 169 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 		 172 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  25.41 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  29.28 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  29.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  28.72 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1093  lipoprotein signal peptidase  28.17 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  29.21 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  25.67 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  28.39 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  26.74 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  28.14 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  24.73 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  28.24 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  28.5 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  27.55 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  25.65 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  26.09 
 
 		 174 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  28.57 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  27.78 
 
 		 184 aa  42  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 		 180 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  23.53 
 
 		 224 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 166 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  27.37 
 
 		 166 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 166 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>