More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3053 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  50.27 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  46.07 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  43.85 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  49.38 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  42.16 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  39.89 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 272 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  41.9 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  44.24 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  44.77 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  38.24 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  39.41 
 
 		 291 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  41.34 
 
 		 232 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  39.43 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 220 aa  91.3  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  40 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  34.97 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  53.09 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.26 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.51 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.98 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  29.84 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  45.76 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  29.25 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.84 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.86 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  34.86 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  27.61 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1808  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.154233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  29.75 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.44 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>