More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3428 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  78.45 
 
 		 232 aa  315  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  47.76 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  49.46 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  51.31 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  56.44 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  53.95 
 
 		 238 aa  141  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  50.66 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  42.53 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  46.95 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  44.57 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  45.33 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  49.13 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  59.18 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  43.78 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  49.14 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  39.88 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  48.97 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  45.71 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  47.1 
 
 		 156 aa  93.2  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  43.86 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 151 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  30.96 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  32.42 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  39.75 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  49.13 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  35.22 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  32.22 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  34.18 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.83 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.18 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 153 aa  62  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.22 
 
 		 180 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  32.16 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 164 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>