More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1293 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  51.69 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  57.45 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  55 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  47.56 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  43.88 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  45 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  43.65 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  61.31 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  35.68 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  43.94 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  41.46 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 291 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  40.27 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  42.56 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  46.94 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  57.14 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 230 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 230 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  41.26 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  40.19 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  42.35 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  43.41 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  40.11 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  42.04 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.57 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 164 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  32.03 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  36.84 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  35.36 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.64 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  41.01 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  38.41 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>