More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2628 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 		 272 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 234 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 		 230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  53.85 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  53.85 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  58.39 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  45 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  46.74 
 
 		 254 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  47.47 
 
 		 291 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 243 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  52.24 
 
 		 238 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  46.58 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  46.71 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 220 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  48.53 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  51.03 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 358 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  42.97 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  44.53 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.93 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.79 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.06 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.03 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.41 
 
 		 358 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  34.13 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  37.04 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  43.95 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>