More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1579 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  81.91 
 
 		 190 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  55.94 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  48.92 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  43.1 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  58.5 
 
 		 156 aa  131  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.25 
 
 		 272 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  38.37 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  48.41 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  49.3 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 243 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  37.5 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  47.16 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  44.68 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  42.68 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 220 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 154 aa  91.3  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 155 aa  88.2  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  35.53 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.19 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  41.09 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  37.57 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.79 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  44.13 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  36.05 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 153 aa  72  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  48.78 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.81 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>