More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1604 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
219 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  57.86 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
224 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  57.04 
 
 
272 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  53.25 
 
 
198 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  53.05 
 
 
197 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  55.56 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  51.98 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  51.92 
 
 
207 aa  138  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  44.55 
 
 
219 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 
212 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  51.92 
 
 
193 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  46.99 
 
 
243 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  52.73 
 
 
201 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  49.05 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  46.6 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  45.34 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  48.24 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  44.2 
 
 
182 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  45.18 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  52.48 
 
 
207 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  45.13 
 
 
232 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  46.32 
 
 
182 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  45.4 
 
 
188 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  49.35 
 
 
182 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 
190 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  43.43 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  59.5 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  38.51 
 
 
169 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.08 
 
 
157 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.4 
 
 
150 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  29.53 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  40.56 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.37 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  32.98 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  32.52 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>