More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1031 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  100 
 
 		 182 aa  353  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  54.49 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  56 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  52.83 
 
 		 212 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  47.56 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  44.77 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  50.98 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 		 272 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  53.52 
 
 		 238 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 291 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  47.18 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  44.51 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  41.08 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  47.5 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 219 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  45.4 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  48.17 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  48.37 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  40.59 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.29 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  40.87 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  41.38 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  39.18 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.24 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  41.91 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.03 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  36.05 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 358 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  38.74 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 357 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  35.03 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  35.51 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  35.22 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>