More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3640 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 272 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  83.55 
 
 		 234 aa  359  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  77.94 
 
 		 224 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  81.02 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  90.57 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  90.57 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  60.22 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  47.87 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  46.39 
 
 		 195 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  54.86 
 
 		 243 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  52.81 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  50.64 
 
 		 207 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  51.55 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 		 197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  49.66 
 
 		 193 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  45.85 
 
 		 207 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  43.6 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  51.08 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.38 
 
 		 182 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 204 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  48.18 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  53.46 
 
 		 182 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  44.02 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  46.29 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  41.34 
 
 		 182 aa  105  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 190 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  50.66 
 
 		 165 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  40.48 
 
 		 227 aa  92  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  37.02 
 
 		 182 aa  90.9  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 149 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 169 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 169 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  57.97 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  36.67 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.21 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.91 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.99 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.52 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 165 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 173 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.16 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 165 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.56 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>