More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3113 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
230 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  98.7 
 
 
230 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  98.7 
 
 
230 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  81.65 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  77.59 
 
 
234 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  75.37 
 
 
224 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  57.06 
 
 
219 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  49.51 
 
 
212 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  48.48 
 
 
195 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  52.23 
 
 
204 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  47.15 
 
 
243 aa  141  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  52.57 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 
197 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  46.86 
 
 
207 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  49.38 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  48.66 
 
 
201 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  43.53 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  49.64 
 
 
238 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  46.34 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  40.11 
 
 
182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 
182 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  42.78 
 
 
182 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  40.17 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  46.24 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  43 
 
 
220 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
182 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  49.39 
 
 
165 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  39.76 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
182 aa  95.9  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 
149 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 
163 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 
169 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 
150 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  51.18 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
167 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  41.01 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  35.29 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.75 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.78 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
154 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 
168 aa  79  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  30.64 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  36.67 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
165 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.36 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.78 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 
165 aa  74.7  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
144 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
155 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  39.22 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36.75 
 
 
174 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.66 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
173 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.38 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>