More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1083 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  56.06 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  61.07 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  61.7 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 		 272 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  43.56 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 		 230 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  45.36 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  48.98 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  48.98 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  42.34 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  40.48 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  54.65 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  49.19 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  42.68 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 		 238 aa  74.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  46.32 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  38.84 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  40.77 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.67 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  55.64 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  41.67 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.5 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  45.13 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.84 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.78 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  40.5 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  40.5 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  43.56 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  40.5 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  50.52 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.7 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  32.53 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  53.27 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>