More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1345 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 
191 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 
169 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
143 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  41.84 
 
 
150 aa  94.4  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  39.69 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
153 aa  90.9  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  40.31 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.99 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4023  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000409916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  34.91 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  33.15 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  41.03 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  33.8 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  33.72 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.12 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  41.04 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  33.83 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  36.49 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  36.88 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.27 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  30.68 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  43.69 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.45 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>