More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2691 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.89 
 
 
157 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  35.8 
 
 
166 aa  92  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.59 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
171 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
166 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
171 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
171 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
170 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
170 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
170 aa  89  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 
171 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
170 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
162 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
161 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.25 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 
173 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
169 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
150 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.59 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.67 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.59 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  38.56 
 
 
364 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.15 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  31.43 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
161 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.06 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 
149 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.11 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>