More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1655 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  58.39 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  57.59 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  55 
 
 		 167 aa  177  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  59.49 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  50.62 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  42.57 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.04 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.77 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  28.78 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  29.79 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  35.81 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.71 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  29.89 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  35.95 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  36.67 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  36.62 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  33.09 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>