More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1605 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
143 aa  276  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  42.65 
 
 
158 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 
145 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  45.38 
 
 
144 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
178 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  43.26 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  45.24 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.19 
 
 
160 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
161 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
207 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 
191 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  44.36 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 
150 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 
154 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  38.73 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  42.97 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  38.81 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.94 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  42.03 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  44.09 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  44.26 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  42.42 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  36.17 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  44.12 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  41.41 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  39.47 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
170 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  40.65 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  43.52 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  42.06 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.13 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>