More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
165 aa  326  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  60.67 
 
 
163 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  57.05 
 
 
158 aa  140  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
165 aa  104  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 
178 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
157 aa  94  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  38.64 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  40.68 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  27.54 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  35.61 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  42.62 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.51 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  38.76 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  27.52 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  27.52 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  28.79 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  31.76 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  30.66 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  29.7 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  35.38 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  31.17 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  35.38 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
243 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.88 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
163 aa  61.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
191 aa  61.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  30.91 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 
197 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
197 aa  60.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  28.67 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 
145 aa  60.8  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
190 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>