More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0255 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  80.53 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  49.35 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  40.53 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  43.54 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 145 aa  94.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 161 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 144 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40.37 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.59 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.46 
 
 		 164 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 164 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  34.94 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  40.14 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.06 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  38.96 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.78 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  41.35 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  35.52 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  33.7 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 150 aa  72  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  39.86 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 153 aa  72  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>