More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0472 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  97.85 
 
 		 186 aa  358  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.5 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.17 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  30.32 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  29.22 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  27.51 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.48 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.06 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  31.13 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  30.95 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.96 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.44 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  35.83 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  28.93 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.5 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  36.8 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  31.39 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  39.09 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.82 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 		 160 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  46.75 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>