More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0948 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  44.19 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  43.51 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  44.7 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 191 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 358 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  34.1 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  37.76 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 359 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  40.51 
 
 		 359 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  33.33 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  38.22 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  43.8 
 
 		 358 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 224 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  37.58 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  37.32 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.81 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  28.22 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>