More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0735 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  43.55 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.33 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
191 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
186 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  33.88 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  39.83 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  32.48 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 
171 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.46 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  35.71 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  32.41 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
171 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  31.51 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>