More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0950 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
130 aa  238  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 
235 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  42.97 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  35.61 
 
 
186 aa  67  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.91 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.1 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  30.88 
 
 
358 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  31.34 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  30.5 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  30.88 
 
 
169 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  34.86 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.28 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
170 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
170 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
171 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 
207 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
171 aa  57.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  35.11 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  29.58 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
168 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  39.42 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  30.88 
 
 
364 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 
172 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>