More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2288 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
191 aa  380  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 
168 aa  118  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  40.53 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 
149 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.1 
 
 
159 aa  94.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
145 aa  91.3  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
153 aa  88.2  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
168 aa  87.8  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 
143 aa  85.1  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
163 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 
164 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  36.88 
 
 
150 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  37.88 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
149 aa  79  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.15 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  35.47 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
160 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.35 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  38.64 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  38.64 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.33 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  28.19 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  43.52 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  36.5 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.69 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  36.67 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>