More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2206 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  80.92 
 
 		 156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  53.44 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  50.38 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  51.28 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  54.62 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  40.54 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 		 195 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  36.44 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.43 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  29.53 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  37 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.87 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  27.61 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.6 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  33.05 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  29.87 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  36.44 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  29.51 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  32.2 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  34.59 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  37.61 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  37.62 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.16 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4118  peptidase A8 signal peptidase II  41.09 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.75 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  27.74 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  29.08 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.65 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  27.27 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.05 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1095  lipoprotein signal peptidase  40.32 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.120995  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  34.31 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  29.51 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  35.64 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  35.64 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  33.07 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  30.47 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  27.98 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  27.71 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  30.83 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  25.95 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.65 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>