More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2655 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 176 aa  339  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  53.44 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  48.06 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  53.57 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  47.15 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  45.24 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.08 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.11 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  34.59 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  40.87 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.37 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  43.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.44 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  33.05 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  33.78 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  36.7 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  42.72 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.18 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  41 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>