More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4429 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  324  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  65.87 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  65.87 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  65.87 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  49.34 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  42.37 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  47.2 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  32.77 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.33 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  37.07 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.06 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.04 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  41.74 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.05 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.23 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.75 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.71 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.61 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  33.07 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  36.7 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  36.7 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  34.38 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 357 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  34.26 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.96 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  32.34 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>