More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2867 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
157 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  51.28 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  51.52 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  56.2 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  51.13 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  55.47 
 
 
176 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  46.67 
 
 
182 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  47.76 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  43.81 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  43.81 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.35 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  40.19 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 
173 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
219 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.4 
 
 
170 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.85 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  39.68 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  33.08 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.25 
 
 
204 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  44.64 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.06 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.35 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  27.97 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  38.39 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.25 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  38.39 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
243 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  30.37 
 
 
145 aa  53.9  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
195 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  35.71 
 
 
123 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  25.76 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.2 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
235 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  37.61 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  29.33 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.38 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
224 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0079  lipoprotein signal peptidase  29.22 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.79 
 
 
144 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
172 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.38 
 
 
174 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
189 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  27.11 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  48.44 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  38.1 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>