More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1135 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
166 aa  329  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
153 aa  90.9  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  30.59 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  32.81 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  33.88 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  30.38 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.07 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.41 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  29.29 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  34.1 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 
202 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1093  lipoprotein signal peptidase  30.88 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 
201 aa  60.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 
186 aa  60.8  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.88 
 
 
160 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.65 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  31.51 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  29.59 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  31.3 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.82 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  33.61 
 
 
227 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  29.34 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
193 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 
173 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.43 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>