281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2611 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 166 aa  330  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  57.76 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  42.62 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  41.44 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  41.28 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.19 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  29.49 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  38.89 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.06 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  32.77 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  27.63 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  37.38 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.17 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  30.67 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  30.95 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  30.61 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  34.58 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  55.77 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  33.06 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  33.98 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  30.08 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.34 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  33.98 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  24.34 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  33.02 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  28.83 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  32.46 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.99 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  27.39 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  33.6 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 272 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  36.73 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  30.94 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>