More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1207 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  340  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  28.21 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3566  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  31.9 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  29.01 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  30.34 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  28.31 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  30.38 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  31.43 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  29.34 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  28.31 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  29.09 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  26.35 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0384  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  25.17 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  27.89 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  27.7 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  28.37 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  35.83 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  29.09 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  29.41 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  29.29 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  27.7 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  26.62 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  29.22 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.47 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  30.12 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.85 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  29.77 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  27.4 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  26.62 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  25.53 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  29.13 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  30.53 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2038  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  28.14 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  28.67 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>