More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0911 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 204 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  48.84 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  44.28 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  44.39 
 
 		 272 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  44.89 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  40.36 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  40.96 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  42.54 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  45.4 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  43.02 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  45.18 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  48.94 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  41.71 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  44.74 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  36.69 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.68 
 
 		 176 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.9 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.5 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.87 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.68 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.13 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  47.15 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.63 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.09 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  34.22 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  34.22 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  40.8 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.21 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.1 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>