More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5747 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  55.61 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  58.16 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 195 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  51.1 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  56 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  49.2 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  42.73 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 201 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 		 220 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  49.1 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  53.66 
 
 		 193 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  54.93 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  54.67 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  44.56 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  48.79 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  46.24 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  53.37 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  54.07 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  54.07 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  56.05 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.21 
 
 		 182 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 182 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  46.56 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  45.91 
 
 		 182 aa  99.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  42.06 
 
 		 210 aa  98.6  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 150 aa  95.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  44.5 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  38.34 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.95 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 169 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.96 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.41 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 160 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.23 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  37.64 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 168 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 163 aa  72  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 143 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  35.84 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  43.17 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  44.63 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 173 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.76 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 160 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 169 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>