More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5736 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 291 aa  563  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  46.7 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  56.17 
 
 		 193 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  43.5 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  48.76 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  48.21 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  48.79 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  50.9 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  52.54 
 
 		 182 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  43.01 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  43.19 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  41.71 
 
 		 204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  43.46 
 
 		 195 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  49.17 
 
 		 220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  56.4 
 
 		 165 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  46.43 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  46.59 
 
 		 182 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  40.85 
 
 		 198 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.81 
 
 		 182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  49.11 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  47.16 
 
 		 182 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  45.88 
 
 		 188 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.79 
 
 		 164 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  40.1 
 
 		 227 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 155 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  47.13 
 
 		 156 aa  87  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 182 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 160 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  37.85 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.51 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 178 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.85 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.57 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 166 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  41.21 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.22 
 
 		 172 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  43.22 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.13 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  25.74 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.22 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  43.22 
 
 		 173 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.32 
 
 		 169 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.13 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.87 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>