More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2402 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  50.57 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  51.14 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  40.18 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  54.04 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  51.59 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  55.97 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  40.34 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  51.09 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  38.5 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  41.81 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  57.06 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  45.16 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  58.68 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  46.62 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  48.59 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  48.32 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  42.29 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  42.86 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  43.07 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  38.86 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  41.52 
 
 		 291 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  43.05 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  47.43 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  41.08 
 
 		 254 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 235 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  38.92 
 
 		 169 aa  89.7  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  43.6 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  36.06 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  48.05 
 
 		 165 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 154 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  41.48 
 
 		 150 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  37.04 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.13 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  40.48 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  39.66 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 158 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  33.71 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 164 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 144 aa  72  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.09 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  32.78 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.91 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  40.15 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>