More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2615 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  100 
 
 		 173 aa  343  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  36.69 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  36.26 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  35.4 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.64 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.84 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.41 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  34.67 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.08 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.79 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  29.71 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  30.32 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 358 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.13 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.72 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.01 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.15 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>