More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1530 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3566  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1364  peptidase A8 signal peptidase II  42.95 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.695053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.85 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.54 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  28.83 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.86 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 358 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  32.82 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.08 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 357 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  29.7 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.3 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  34.06 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  31.97 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.35 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  34 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  29.82 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  32.77 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  32.77 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  33.88 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  26.97 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>