255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1364 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1364  peptidase A8 signal peptidase II  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.695053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.7 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  29.19 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.91 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  29.41 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  29.59 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38.94 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  29.48 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  30.65 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.16 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  30.54 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  28.83 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  38.6 
 
 		 358 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.59 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  28.3 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  34.53 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  28.82 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  27.49 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  33.09 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  28.16 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  27.87 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  28.66 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  29.7 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  28.36 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  28.99 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  33.33 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  30.85 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  29.09 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  32.74 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  35.47 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  29.24 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  29.24 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  29.24 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 		 170 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3566  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.14 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>