267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3566 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3566  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.7 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  28.07 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  31.07 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.53 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  28.86 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  31.9 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  29.56 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  30.19 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  31.55 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  31.1 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  32.67 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  36.04 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  30.54 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  28.08 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  28.83 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  26.16 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  26.16 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  28.98 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  29.81 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  25.69 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  29.09 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  27.08 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  30.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>